讲述了蚩尤身为实力强大的兵主，肉身虽死但其神魂不散，传说千万年轮回后，人族中将有一人继承蚩尤兵主之魂一统山海界，打破黄帝设下的桎梏重返炎黄大陆。随着临海城一位名叫黎石的少年长大，兵主之魂显现，巫族和妖族暗流涌动，为称霸山海界正酝酿一场巨大的人间浩劫的故事。
风和日丽的一天，内裤大盗八宝斋（永井一郎 饰）洗劫风林馆高中女子更衣室，最终中了乱马（山口勝平 饰）的美人计，还遭到女生们的一通暴打。愤恨至际的八宝斋做出了神秘的春眠香，只要闻过此香整个冬天都不会醒来。八宝斋与乱马在家中进行攻防战，无意间却将香喷到小茜的身上。未过多久，小茜在课上沉沉睡去，却变成无人能够近身的睡梦武功高手。而另一方面，小茜陷入了无休无止的梦中世界。对于乱马来说，这无疑是悲剧的开始……
小学时期，游泳部的四名成员在毕业前的游泳比赛中夺冠，之后他们毕业的毕业，出国的出国，四人分道扬镳。时过境迁，就读岩鸢高中的七濑遥（岛崎信长 配音）和好朋友橘真琴（铃木达央 配音）升上高二，他们与昔日的游泳部成员之一叶月渚（代永翼 配音）重逢。三人回忆起小学时光，约定到曾经的游泳馆去。在废弃的游泳馆里，他们居然遇到了归国的松冈凛（宫野真守 配音）。意料之外的是，昔日战友凛性情大变，还对遥发起挑战，结果遥输给了他。 遥、真琴和渚决定成立游泳部，经过多番努力后，终于招募到了新成员龙崎怜（平川大辅 配音），他们以县大赛冠军为目标，进行紧张的集训。另一方面，凛所在的鲛柄学院游泳部也在为大赛作准备。他们约定，要在赛场上决一高下。充满激情和活力的游泳部，在这个夏天，开始了关于友情与青春的Free!故事。
