《百花缭乱 武士少女》是日本ホビージャパン（Hobby JAPAN）出版社创业40周年的跨媒体制作企画。该企画的小说作者为日本的编集者、著作家·铃木ドイツ（すずきあきら）【铃木晓】。同时TV动画也预计在2010年10月开始在独立UHF局以及AT-X电视台播放。但在2010年9月3日在TOKYO MX电视台先行播放了第一话。故事发生在21世纪初叶的日本，此时的年号是“平诚”。虽然锁国政策已经完结，但德川幕府的统治还在继续。在富士山的山脚有一间巨大教育机构·武应学园塾。这里的部分学生对德川家进行反抗，学生会执行部称其为“丰臣狩猎”，并对其进行镇压。本作的主人公、柳生道场的代理师傅·柳生宗朗虽世代为德川效力，但他却对执行部的镇压行动抱有疑问，为此却被学生会命令撤走道场。撤走期限即将来临之际的一天晚上，宗朗与真田幸村后藤又兵卫被学生会直辖部队追杀逃进柳生道场秘密房间后，突然从天空堕下一名手持双刀的全裸美少女。自称柳生十兵卫三严的少女击退了强袭道场的服部忍者，从此之后，就有众多日本历史上的武将以少女身份出现在宗朗面前。
墨纪城是唐晓柔放不下的年少念想，十几年的着迷和折磨，令唐晓柔一度想放手，就连婚姻也被他拿去算计，可是这样冷漠万分的墨纪城主动贴上来的时候，她又仍不住心动。虐到深处方显情深，唐晓柔与腹黑老公来回过招之间，在对方心里留下一片涟漪、久久不散，似乎命运注定她不会逃走他的手掌心。
影片讲述了小女孩菲菲的奔月故事。菲菲从小听着妈妈讲述的嫦娥与后羿的爱情故事长大，她坚信嫦娥是真爱永恒的化身。妈妈去世几年之后，爸爸准备再婚，菲菲深受打击。为了捍卫自己的家庭，为了向爸爸证明，嫦娥还在月球上永志不渝地等待后羿，她所代表的永恒真爱是真实存在的，菲菲自己动手制作了一艘“火箭飞船“，开启一段奇妙的奔月之旅。
古海在灵池内疗伤，被蛊虫迷惑心志，差点被控制的时候，小柔突然冲出来挡住蛊虫的侵蚀。被蛊虫报复的小柔遭遇到巨大的冲击，体内的能量突然爆发，灵力大散，小柔受了重伤。古海从幻境中醒来，发现受伤昏迷的小柔被蛊虫包围，立刻帮助小柔驱散蛊虫。感到心痛的古海决心一定要救活小柔，他不能再面对第二个为他而死的女人了。然后怜生大师为救POPO体力大失，也无法救助伤重的小柔。情急之下，只有抢蟠桃的办法了。于是四人小分队又面临与九公子大战的情境。结果，奕天阁发动了阻止蟠桃被抢的反攻，邪恶的蟠桃树散发出吸食人血的阴暗魔力，无数修仙者都丧命在去蟠桃的路上。古海一行人发现了蟠桃的机密，决心救助小柔后破坏这个邪恶的地方。在于九公子的大战中，三人接连受重伤，千钧一发之际，POPO爆发出了强大的能力，与九公子最终厮杀。然后在战事焦灼的时候，被小柔灵力吸引来的大明王神和陈太极一直在高处观战，他们也在伺机抢走蟠桃，而且他们想要的，也远远不止蟠桃那么简单…
