本片是《麦兜故事》系列的第三部，由现实和动画两部分故事组成。
The battle that began in another world is now a war waged on Earth.
学校里的音乐大赛结束了。可是日野香穗子仍然一如既往地进行着小提琴的练习。她再次对自己与其它参赛选手之间的实力差距有了认识，但仍然抱着喜欢小提琴的心情全心投入地继续努力着。可是此时有一个看到她练习时样子的少年卫藤桐也，却对她的努力报以冷淡的语言。而且随着星奏学院下一任理长吉罗晓彦的登场，发生了更加令人震惊的事件！在这种情形下，香穗子的面前又出现了一个神秘的转学生加地葵……
讲述Poppy和Branch有了一个惊人的发现——除了他们之外，还有其他的魔发精灵世界，各部落的明显差异导致了巨大的冲突。当一种神秘的邪恶力量让所有的精灵世界都面临危险时，Poppy和Branch以及朋友们将踏上一段史诗般的探寻旅程，在长期不和的各精灵族群中创造和谐氛围，让大家团结起来对抗某种厄运。
在纽约出现了一只神秘的数码兽，他利用自己特殊的力量将太一、阿和、阿空、光子郎、美美、阿丈带到了一个陌生的世界。同时，在纽约的八神光和高石武发现了这只数码兽，并且看到一个美国小孩与数码兽对话之后逃走的情况。巴达兽悄悄地尾随其后，得知这个小孩要去一个叫“花场”的地方寻找“夏天的回忆”。大家赶至那里。 收到小光的电子邮件的大辅他们马上坐飞机来到了美国......
天才兼疯子科学家Rick（贾斯汀·罗兰 Justin Roiland 配音）在失踪多年后突然回到女儿Beth的身边，并且在她的车库里搞了一个科学实验室。Rick有一把“传送门枪”，可以穿越到宇宙的各个次元。孙子Morty（贾斯汀·罗兰 Justin Roiland 配音）和孙女Summer经常被拖进他的自制太空船内，跟他一同开展各种疯狂刺激的宇宙冒险。女儿和女婿Jerry对他的疯狂行为感到不满，在上一季的结尾，他们外出旅行回来，发现屋子被爷孙三人搞得一团糟，正要大发雷霆之际，Rick停止时间，趁机整理好房子。他们却因此创造了多个时间断层，这下又该如何收拾？
本作主人公是三只拟人化的熊，分别是热血灰熊Grizzly（埃里克·埃德尔斯坦 Eric Edelstein 配音），宅男熊猫panda（鲍比·莫伊尼汉 Bobby Moynihan 配音），全能北极熊Ice Bear（迪米特利·马丁 Demetri Martin 配音）。三个熊兄弟一同住在森林的一个山洞里，常常碰到出其不意的事情，它们既有人类朋友Chloe，也有大脚怪朋友查理。三个熊兄弟按照周围人类的行为准则，竭尽所能成为人类社会的一员。
衰仔高三生路明非，突然收到了一封来自卡塞尔学院的邀请信，这一件天上掉馅饼的大好事砸得他有一些不知所措，经历了一系列事件后，路明非决定面对未知，加入卡塞尔，谁知竟被告知，卡塞尔的学习之旅是为了——屠龙。学院“自由一日”和“3E”考试等等不同寻常的事件让他不得不相信自己真的加入了一个目标是屠龙的神秘组织，随后去往青铜城的行动也让他直面了自己已然到来的、不平凡且残酷的人生……
