故事发生在《加勒比海盗3：世界的尽头》沉船湾之战20年后。 男孩亨利（布兰顿·思怀兹 Brenton Thwaites 饰）随英国海军出航寻找被聚魂棺诅咒的父亲“深海阎王”威尔·特纳（奥兰多·布鲁姆 ...

　　碧海蓝天、安逸舒适的港口城市杜王町，在过去三年里相继发生离奇诡异的死亡事件。一时间天堂变成地狱，人人自危。废柴男生广濑康一（神木隆之介 饰）上学路上遭到不良少年刁难，不过却由此结识了同班同学东方仗助（山崎贤人 饰）。留着飞机头的东方仗助拥有神秘的“替身”，这让他和他人截然不同。他通过“替身”制止了一场便利店抢劫案，结果反被连续杀人事件的制造者安杰洛——片桐安十郎（山田孝之 饰）盯上。不久后，名叫空条承太郎（伊势谷友介 饰）的男子来到杜王町，东方由此知道了自己的身世。与此同时，名叫虹村形兆（冈田将生 饰）且拥有替身能力的男人露出了他的爪牙，一场大战在所难免……
　　本片根据荒木飞吕彦的同名漫画改编。

上世纪70年代，一支集结了科考队员、探险家、战地摄影记者、军人的探险队，冒险前往南太平洋上的神秘岛屿——骷髅岛。他们的到来惊扰了岛上之神——史上最大金刚。经过一番惨烈的激战之后，探险队员散落在了岛屿各处。此时，队员们才意识到这次探险并不是一次单纯的科考任务，而是去探索怪兽存在的证明。在这片与世隔绝、危险密布的丛林，无数怪异的史前生物暗藏其中，时刻威胁着他们的生命。队员们还遇到了神秘的原始部落，金刚的身世和其守护岛屿的原因也被逐渐揭开，原来，恐怖阴森的骷髅岛上还蛰伏着更凶狠残暴的怪兽……

当TripleX项目的创始人吉布森（塞缪尔·杰克逊饰）被杀害了的时候，美国国安局特工马珂（托妮·科莱特饰）决定请回自假死后一直被政府跟踪的桑德·凯奇（范·迪塞尔饰）。为了给吉布森报仇，同意回归，招募了一个新的TripleX团队，人员包括狙击手阿黛尔·沃尔夫（露比·罗丝饰），特技驾驶员火炬泰尼逊（罗伊·麦克凯恩饰）、夜店DJ尼克斯（吴亦凡饰），还有计算机分析师贝基（妮娜·杜波夫饰）。桑德·凯奇团队针对的坏特工们包括头目项（甄子丹饰）、致命杀手赛琳娜·昂格尔（迪皮卡·帕度柯妮饰）、武术专家塔隆（托尼·贾饰），还有武器专家霍克（迈克尔·比斯平饰）。但当两个团队相遇时，突然发现事情并不是看上去的那样，有可能两拨人的目标是一致的。此时此刻，这两只TripleX队伍为了阻止未知的敌人，必须携手合作