二十年前异族入侵，中原武林发生了一场旷日持久的血战。最终只剩八人，从此“八大高手”成为整个中原武林的泰山北斗，江湖的和平持续了整整二十年。八大高手之一“巨灵战神”薛力士已归隐田园，却死在农田中。紧接着，八大高手中的另一位魔教长老赵乘风也死在家中。六扇门奉命调查此案。而六扇门总捕头叶无忌也是八大高手之一。叶无忌的徒弟段小峰大胆推断这两人都是死在自己的成名绝技之下，江湖中出现了一位如当年的长孙氏一般能“以其人之道还治其人之身”的高手。年轻气盛的段小峰决定独自去往扬州查案，途中结识了赵乘风的义女王非烟，并与潇湘馆的伎官孙盈互生好感，八大高手相继遇害，其实孙盈就是“以其人之道还治其人之身”的神秘高手。

明朝年间，兵部尚书麾下的百户段天昊为查出倭寇与阉党勾结销赃的证据，加入锦衣卫，几年来一直潜藏在太监总管张公公身边。就在他终于得到线索，准备与多年兄弟总旗苏子峪里应外合抓住犯人时，兵部尚书刘大人得到阉党利用倭寇陷害福州知府的线报，并派出段天昊的弟弟段天麟到倭寇处卧底。段天昊与苏子峪只得放弃到手的功劳，前往福州，却不曾料到竟是一场有去无回的凶险之旅。

二十年前长孙家遭八大高手灭门，长孙盈、长孙卿带着家传武学从秘道逃脱后，追随拜火教主东方彬，分别化名孙盈、王太白，自此决心杀八大高手报仇。段小峰与王非烟继续查案，亲眼目睹蔡上将殒命，又接到了长春子的死讯。灰心丧气的段小峰回到京师偶遇假装被卖到沙洪帮的孙盈，将其带回叶家安置，当孙盈决定放弃杀叶无忌正准备离开时，却被叶无忌发现其真实身份。二人决战欲做了断，战后两败俱伤。身负重伤的叶无忌回家途中被王太白暗害。峨眉派逍遥子到六扇门奔丧，段小峰从其伤口发现，这正是那夜追杀他们的黑衣人。明白了一切的段小峰携王非烟前往拜火教总坛光明峰。正邪两派人马、以及两拨凶手齐聚，此案的真相以及二十年前的秘密被一一揭开。